首先仔细观察鳄龟的尾巴，一般雄性鳄龟的尾巴是由长又粗大，而雌性鳄龟的尾巴则是由短又细小，不过这个方法只适用于分别一斤以上的鳄龟。
然后再观察鳄龟的泄殖孔与腹甲的距离，一般来说，雄性鳄龟的泄殖孔距离腹甲比较远，而雌性鳄龟的泄殖孔距离腹甲会比较近一些。
观察鳄龟的嘴巴是否有下钩，一般来说，雄性鳄龟的嘴巴都会有钩，而雌性鳄龟的嘴巴就没有下钩了。
仔细观察鳄龟的舌头颜色，一般来说，雄性鳄龟的舌头颜色为浅红色，颜色会比雌性鳄龟的舌头颜色浅得多，而雌性鳄龟的舌头颜色为深红色。
然后再仔细观察鳄龟的背刺纹理，一般来说，雌性鳄龟的背刺纹理比较清晰可见，而且纹理的颜色是黑色的，而雄性鳄龟的背刺纹理则比较粗糙，颜色会发黄。
如果鳄龟受惊的话，则其尾巴会扭动，而雄性鳄龟的尾巴则是朝下扭动，而雌性鳄龟的尾巴则是左右扭动。
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