一、关于计提、缴纳期限
何时计提，主要看主管征收部门核定征收期限。当然，如果按月计提，从会计核算上无疑是最准确的；只不过即使按月计提，缴纳时按照规定期限即可。但通常来讲，最长肯定不能超过一年计提。
二、适用会计科目
（一）按照目前会计政策要求，原先的“营业税金及附加”科目修改为“税金及附加”科目，核算范围与之前差不许多（主要是增加了原先管理费用下的房产税、土地使用税、车船税和印花税），包括企业经营活动而发生的消费税、城市维护建设税、资源税、教育费附加及房产税、土地使用税、车船使用税、印花税等相关税费。而小企业会计准则与之相对应的“营业税金及附加”科目列举其核算范围时，还包含了土地增值税和矿产资源补偿费、排污费等项目。
残疾人就业保障金与上述教育费附加和矿产资源补偿费、排污费等项目类似，可以通过“税金及附加”或者“营业税金及附加”（小企业会计准则）科目核算。
（二）通常，残疾人就业保障金先计提、后缴纳，可以通过“应交税费——应交残疾人就业保障金”过渡。
三、账务处理
（一）计提残疾人就业保障金
借：税金及附加（小企业会计准则：营业税金及附加）
贷：应交税费——应交残疾人就业保障金
（二）缴纳
借：应交税费——应交残疾人就业保障金
贷：银行存款
（三）直接减免
1、若全部减免，可以不必计提；
2、若部分减免，可以仅就减免后实际应缴金额计提。
3、若希望账面反映减免金额，也可以先行计提，然后原分录冲回。
借：税金及附加（小企业会计准则：营业税金及附加）
贷：应交税费——应交残疾人就业保障金
借：应交税费——应交残疾人就业保障金
贷：税金及附加（小企业会计准则：营业税金及附加）
鉴于直接减免特性，不宜结转递延收益、其他收益等科目。
（四）如果因为“多交”而退还
借：银行存款
贷：应交税费——应交残疾人就业保障金
借：应交税费——应交残疾人就业保障金
贷：税金及附加（小企业会计准则：营业税金及附加）
若因为跨年度而多交退回，则将上述税金及附加改为“以前年度损益调整”科目；同时，相应所得税调整处理也是通过“以前年度损益调整”。调整完毕，将“以前年度损益调整”结转“利润分配——未分配利润”，相应再调整盈余公积等项目及相关报表项目。小企业会计准则采取未来适用法，不必做如上调整。
（五）如果属于政策性“先征后返”
借：银行存款
贷：递延收益、其他收益或者冲减税金及附加、以前年度损益调整（后续调整同上；小企业会计准则计入“营业外收入”即可）