两票制的执行，意味着在过往流通领域中代理商、经销商、配送商的角色将被压缩成一个。在整个流通环节的压缩过程中，多票、过票、挂靠、避税行为将大大减少，利润更为透明。而且，两票制实施的主要目的，就是有效减少药品从药厂到医院的流通开票环节，从而降低药品成本。
若是从这角度来看，“两票制”改革的实施将使得整个医药行业虚开的风险得以显著的下降。但是，事实果真如此么？
一、两票制下虚增费用的医药企业不减反增，虚开的金额以推广费、劳务费、宣传费等名义送给医生当做回扣
在两票制开始实行后，中国裁判文书网公布的关于医药公司虚开增值税发票案件却没有想象中的大幅度减少。
在中国裁判文书网上搜索“医药”、“虚开增值税专用发票”字段可以发现，从2016年开始截止至20230年，关于医药公司虚开发票的涉税刑事案件679件。（2016年4月6日，国务院审议通过了《深化医药卫生体制改革2016年重点工作任务》，明确提出在再综合医改试点省份(11省、直辖市)和公立医院综合改革试点城市(200个地级市)推行“两票制”，全国“两票制”改革拉开帷幕。）
从曲线图中可以看出来，在2016年在医改试点省份、公立医院综合改革试点城市推行两票制后，从2016年到2023年，虚开发票这个税务刑事犯罪并没有因此降低，反而大大提升，医药企业税务犯罪稳步增长。2023年出现的“转折”，部分原因是2023年国家针对医药腐败问题陆续发布一些相关政策以及财政部宣布加强药企税务监管等其他“因素”，对其起到一定的“警示”、“制约”，所以