知方号

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1. 生信软件系统的选择——Linux(ubuntu)

对于生信分析人员来说,日常工作,软件运行,跑流程,均在linux下操作。当然,也有基于云端的生信分析平台,如免费的Galaxy,或者某些 公司的一站式云平台。

比较初学者学生物信息还是使用开源软件、学原理、一步一步运行才有意思。这路子,一定要适应Linux的命令行界面。

选择windows还是linux? 一定是linux,windows太多的生物软件不兼容了。选择linux的哪个版本?推荐桌面版的Ubuntu——稳定,美观,适合初学者之称;次之,Centos——免费、稳定的服务器linux版本之称。用那种方式安装linux好?推荐虚拟机安装。不太建议双系统,云端这种。因为,对于初学者在系统中,需要反复折腾,测试,搞垮系统是常事。选择开源的VMbox还是商业版VMware?两者都可以,但各有缺点。VMbox更新比较快,经常更新后,可能会出现报错,系统无法打开的现象,较低版本的反而比较稳定,如果用好了,不建议经常更新。还有一点是,VMbox在鼠标控制上,没有VMware流畅。VMware十分稳定,流程好用。最新版一般要收费。可以选择比最新版版本稍低的,上网搜注册码,免费使用。还是那样,用好了,不要经常更新。某些生信软件会提供VMbox的镜像,如qiime。VMbox的镜像能不能转到VMware上使用?,答案是可以的,使用VMbox的镜像导出功能,然后使用VMware进行导入,保持两者格式相同。 2. Ubuntu镜像下载

ubuntu镜像下载官网:https://www.ubuntu.com/download

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