1.TCMSP数据库没有相关成分怎么办？答：可以从其他数据库获取成分靶点，比如ETCM、Symmap、YaTCM、TCMIP数据库，或者查找最新文献补充。
2.从其他数据库获取的化学成分没有MOLID怎么办？
答：MOLID只是这个化学成分在TCMSP里的代号，你可以自己给它编写一个，或者全部成分统一编码，比如M1、M2、M3........。
3.筛选活性成分时，OB 和DL值的依据是什么？
答：一般来说会活性成分的筛选标准是OB（口服利用度）>30，DL（drug-likeliss，类药性）>0.18。标准是通用标准，如果你筛选的成分太少，也可以适当降低标准，比如把数据调整为20 和 0.15等，有的中药的给药途径不是口服给药，那么就可以不考虑OB值，因为OB是反应药物经胃肠道吸收进入血液的含量，那么比如静脉给药、经皮给药、黏膜给药等方式不经过胃肠道，就没有必要考虑OB值。另外通过文献查询和实验所获的等活性成分，也可以不必考虑OB和DL值，尤其是你正在研究等成分，直接补充上去。
4.活性成分如何预测靶点？是不是用多个数据库预测？
答：特别强调，原则上：活性成分的靶点预测，最好只用一个数据库的结果，因为不同数据库预测成分靶点的计算方法不一样，标准不一样，混在一起不科学。就比如选美，唐朝认为胖为美，当代认为瘦为美，非洲认为黑为美，如果你把当时当地认为美的人排排坐，是很恐怖的。当然，如果你的数据库没有该物质的靶点，才可以从其他数据库进行补充。再强调一下：活性成分靶点最好用一个数据库的。
5.疾病靶点如何预测？是不是可以用多个数据库预测？
答：疾病靶点的预测多多益善，因为疾病的靶点基本都是被证实的作用靶点，不是预测的靶点，可信度非常高，所以越劝越好。介绍了多达5个数据库的疾病靶点，比如genecard、OMIM、TTD、pharmgkb等，而且可以通过R脚本，一键剔除重复靶点，获取并集靶点，绘制漂亮的Venn图。
6.Genecard获取的疾病靶点太多怎么办？
答：可以根据Relevance score来调整，一般选择Relevance score大于1的，如果比较少靶点，选择Relevance score大于0的。如果还太多，选择大于10 的。具体可以参考相关文献或者依据实际经验。
7.为什么视频里Cytoscape软件界面和自己的不一样？
答：不同版本的Cytoscape界面稍微有不同，大家熟悉下几个菜单的位置即可，不影响后续操作。尤其是找到style菜单的位置。另外苹果系统和微软系统界面的软件也会有差异。
8.SwissTargetPrediction预测的成分靶点如何筛选？
答：SwissTargetPrediction作为预测成分靶点的常用工具，一般从pubchem里下载成分的2d结构，导入SwissTargetPrediction数据库，然后选择probability（可能性）大于0.1的即可，也可以调整这个值。建议大家做成分靶点获取的时候，从单一网站获取，不要再去混好几个数据库了，这和疾病靶点获取不一样。
9.Biosgenet 插件无法装载或不能使用的问题？
答：Biosgenet插件获取基因的蛋白互作网络关系，筛选核心基因，说实在的，运行非常慢，建议大家换个方法，采用string网站预测蛋白互作网络关系，再通过cytoNCA插件筛选核心基因。
10.CytoNCA插件无法下载安装怎么办？
答：没有好办法，换个时间、换个网络、手机热点