最近更新频率很慢,因为我忙于课题,没有很多大块的时间进行学习。现在深刻的体会到实验室的氛围如果很好的话(这里的氛围指的是同学以及老板),做起实验来也是充满动力的,而且心情也会很好,每天都感觉充满希望。虽然没有大块时间学习,但是日常的小技能还是经常会get到一些,今天要分享的就是如何查询NCBI里基因信息的历史版本。
在NCBI里查询某个基因的信息时,我们经常能看到这样的注释:
网站会告诉你关于这个基因的信息最近的更新时间。那么我就在想,那之前的记录还可以查看吗?如果有的话,应该去哪儿查询呢?
这项技能非常的easy,NCBI官方有一个网页就是介绍如何查询sequence revision history:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sequencerevisionhistory/
现在举个例子:比如上面截图里显示的基因,首先我们先要找到它的Accesion ID。点击页面右侧的RefSeq:
这时会自动跳转到该基因所有已知的isoforms,比如这个基因,就有3个isoforms(见下图),选择你想要查看的isoform,这里我就用第一个作为例子。实际上这个NM和NP开头的数字就分别是核酸和蛋白的ACCESSION,但这里要注意的是,你要使用小数点前面的内容来进行查找。比如这里,如果你想查看该基因核酸序列所有历史版本,你需要的ACCESSION ID是NM_001252313:
重点来了,现在复制这个网址(如果你要查询其他基因,把