杂交水稻问世时间是1963年，由美国人Henry Beache于印度尼西亚完成的。Henry Beache也被学术界某些人称为杂交水稻之父，并由此获得1996年的世界粮食奖。由于Henry Beache的设想和方案存在着某些缺陷，无法进行大规模的推广。1973年，以袁隆平为首的科技攻关组完成了三系配套并成功培育杂交水稻，实现了杂交水稻的历史性突破。
先后于2000年、2004年和2011年实现了超级稻亩产700公斤、800公斤和900公斤的第一期、第二期、第三期目标，亩产1000公斤的第四期目标也于2014年10月实现历史性突破，为进一步大面积、大幅度提高水稻产量奠定了基础。1995年他当选为中国工程院院士。被称为杂交水稻之父。
随着杂交水稻的应用推广，使单位面积产量得到提高并减少用种量；杂交水稻直播栽培技术就是省去传统的水稻栽培育秧过程，把经过浸种、催芽的稻种直接播到大田中，加以管理，使之成秧、分蘖一直到成熟的一种简化栽培方法。
2023年11月2日，在湖南省衡阳市衡南县清竹村进行的袁隆平领衔的杂交水稻双季测产达到了亩产1530，76公斤，其中早稻619，06公斤、第三代杂交水稻晚稻品种“叁优一号”911，7公斤，超过了1500公斤的预期目标。