蒙巴萨位于肯尼亚（全称：肯尼亚共和国THEREPUBLICOFKENYA）东南沿海的蒙巴萨岛上，有铁路桥与海堤和大陆相连，濒临印度洋的西侧，是肯尼亚的最大港口，也是东非的最大港口之一。早在3000多年前这里就是重要的通商口岸，中国明代的郑和也曾到过。该港是东非的工商业中心，主要工业有炼油、纺织、修船、水泥及农产品加工等。肯尼亚、乌干达的大部分外贸物资及卢旺达、坦桑尼亚以至扎伊尔东部、苏丹南部的一部分货物均由此中转。蒙巴萨国际机场有定期航班飞往世界各地。
该港属热带草原气候，盛行东南风。年平均气温约24度，全年平均降雨量约1200mm，平均潮差约1.8m。
港区主要码头泊位有16个，岸线长2343米，最大水深13.4米。装卸设备有各种岸吊、可移式吊、龙门吊、集装箱吊、抓斗吊、轮胎移动吊及滚装设施等，其中集装箱最大起重能力为40吨。港区有转运货棚面积达9.2万平方米，另有冷库及货场等。码头最大可靠泊6.5万载重吨的船舶。1992年集装箱吞吐量达为13.5万TEU。主要出口货物为象牙、皮张、纤维、棉花、茶叶、椰干、咖啡、木材、糖浆、肉类及奶制品等，进口货物主要有机械、车辆、纺织品、粮食、建材、食品、糖及工业品等。在节假日中圣诞节一般封港。其它节假日可安排作业，但须付加班费。
蒙巴萨港位于非洲东岸中部，而由此向北直到红海几乎再没有大港，向南直到南非只有德班港才能与其媲美，因此她是非洲东岸最大的港口。
蒙巴萨港的条件在东非诸多港口中首屈一指。该港有各类万吨级以上泊位21个，港口吃水9.45米以上，24小时通航，其中16、17和18号泊位是集装箱专用泊位，码头吃水10.45米，有40吨集装箱桥吊4台。专用泊位紧张时，邻近的14号散杂货泊位也用来装卸集装箱。集装箱港区前沿堆场，有专用铁路直通肯尼亚首都内罗毕、肯尼亚第三大城市克苏木和乌干达首都堪培拉，每天都有集装箱专列发往内罗毕。蒙巴萨港务局在内罗毕、克苏木和堪培拉都设有CFS堆场。此外，从蒙巴萨到卢旺达、布隆还有"门到门"公路联运服务。据不完全统计，蒙巴萨港每年集装箱进出口约15万～20万TEU，大约是邻近港口进出口量的3～4倍。
目前，在东非经营洲际集装箱班轮航线的船公司，主要有马士基、铁行渣华、以星、地中海航运、商船三井、日本邮船、美国总统以及太平船务等。上述船公司提供了周班，甚至一周二班服务，航线直达欧、亚、美，而经营东非沿海班轮的FEEDER船公司则