如果所投资行业属于限制类的，则需先行经过商务部门（俗称外资委）的审批，在获得审批之后，再到工商登记机关进行工商登记。
而如果所投资行业属于非限制类的，则无需经过商务部门的审批，可直接到工商登记机关进行工商登记。
值得注意的是，外商投资企业的境内再投资，一种方式是新设公司，而另一种方式，则是由该外商投资企业购买其他公司的股权。对于以新设公司方式进行的非限制类行业的境内再投资，在完成新设公司的工商登记之后，应当到商务部门进行备案登记。而股权购买的方式则无需进行该备案登记。
二、外商投资企业再投资可不可以可以。外商独资企业是一家投资性外商投资企业，则你公司被收购后将变成外商投资企业；否则，该外商独资企业是普通的外商投资企业，因其是一家境内机构，你公司被收购后仍是内资企业。
严格的外商企业再投资，就是指该外资企业参股别的企业，具体形式包括新设、并购（股权收购，就是你公司的情况），增资，除上述说的特殊情况外，所设立（或购买、参股）的企业仍为内资企业。
还有一种情况是外商投资企业外方所得再投资，如外方投资者（外商）以所投资的企业产生的利润去设立或购买一个企业，则后成立的企业和产生利润的企业一样，“都是外商做为股东成立的”，都是外商投资企业。
三、外商投资企业再投资设立企业的性质认定根据《关于外商投资企业境内投资的暂行规定》（对外贸易经济合作部、国家工商行政管理局[2000]第6号）的规定，外商投资企业向中西部地区投资，再投资注册资本中外资比例不低于百分之二十五的，可享受外商投资企业待遇;中西部地区的再投资公司凭《外商投资企业批准证书》和《（加注）营业执照》享受国家法律、法规规定的外商投资企业待遇。
根据《关于外商投资举办投资性公司的暂行规定》（对外贸易经济合作部令[1995]第4号）的规定，投资公司投资设立企业，投资公司或与其他外国投资者的外汇投资比例不低于其所投资设立企业的注册资本的25%的，其所投资的企业享受外商投资企业待遇，发给外商投资企业批准证书和营业执照。
除了以上两种情况，外商投资企业再投资设立的企业均属于内资企业。
相信大家通过对以上文章的阅读，对于外商投资企业境内再投资流程已经有了一定的了解。以上是找法网编辑对外商投资企业境内再投资流程的介绍，希望对您有帮助。如果您不懂如何起诉，可以咨询找法网律师，他们会给您专业的建议。