原来只有房地产开发企业可以适用这个土地价款抵减政策。由于A公司是非房企，所以A公司应缴纳的增值税销项税额为：
1090/1.09×9%=90（万元）
因转让工业厂房，A公司应缴纳的增值税税额为：
90-60=30（万元）
二、附加税费：
城市维护建设税、教育费附加、地方教育费附加，以纳税人依法实际缴纳的增值税为计税依据。
所以A公司应缴纳的附加税费为：
30×（7%+3%+2%）=3.6（万元）
三、企业所得税：
根据《国家税务总局公告2023年第8号》以及《财政部、税务总局公告2023年第13号》相关规定：小型微利企业年应纳税所得额不超过100万元的部分，减按12.5%计入应纳税所得额，超过100万元但不超过300万元的部分，减按25%计入应纳税所得额。
A公司应就收到的转让价款，按照不含税收入并入应纳税所得额，计算企业应纳所得税额，并结合企业情况判断是否可以适用税收优惠政策。
四、印花税：
根据《中华人民共和国印花税法》规定：“应税产权转移书据的计税依据，为产权转移书据所列的金额，不包括列明的增值税税款。”税率是价款的万分之五。
因此，A公司销售厂房应交纳印花税为：
1090/1.09×0.05%=0.5（万元）
五、土地增值税：
土地增值税的扣除项目有两种计算方式，一种是新房销售，另一种是旧房销售。那么新房和旧房如何判断呢？根据：
显然A公司销售使用过的工业厂房，是属于旧房销售的范畴，应当按照旧房销售缴纳土地增值税！
但如果A公司销售的是未使用过的工业厂房呢？是否可以享受新房销售的加计扣除政策呢？
根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》和《中华人民共和国土地增值税暂行条例实施细则》相关规定：对从事房地产开发的纳税人可按规定计算的金额之和，加计20%的扣除。
根据以上政策可以看出，新房销售的主体仅限于房地产开发企业！所以说，如果A公司销售的是未使用过的工业厂房，是不可以按照新房销售的加计扣除政策处理的！
故在本案例中，A公司应当按照旧房销售的方式计算土地增值税，具体如下：
1、应税收入：1090/1.09=1000（万元）
2、扣除项目：
① 评估价格：重置成本价×成新度折扣率=1000×60%=600（万元）
② 转让环节交纳的税金：3.6+0.5=4.1（万元）
③ 扣除项目合计：600+4.1=604.1（万元）
3、增值额：1000-604.1=395.9（万元）
4、增值率：396./604.=65.59%
5、土地增值税：396.×40%-604.×5%=128.25（万元）
以上就是小编对于非房企转让工业厂房的涉税处理分析，当然在执行的过程中，各个地区的税务机关执行口径可能存在差异，企业需要在现有政策的基础上，结合具体业务，提前判断对企业有利的适用政策，并按此思路与税务机关沟通。
作者：中道财税-李欣查看