南京大学资本运营有限公司因校企改革需要于2023年4月6日成立，代替原南京大学资产经营有限公司代表学校对经营性资产行使投资、经营和管理职能，南京大学是公司的唯一出资人，公司注册资本2亿元人民币，统一社会信用代码：91320106MA25LTK9XX，法定代表人及公司董事长由尹建康担任。经营范围包括：授权范围内的国有资产经营、管理、转让、投资，企业托管，资产重组，高新技术成果转化和产业化等。
南京大学资本运营有限公司现有各级企业都与南京大学教学科研密切相关，依托南京大学的学科优势和科技成果不断发展，这些企业涉足电子器件、计算机软件、新型材料、环保、光学传感以及编辑出版、规划设计等行业。
南京大学资本运营有限公司将立足南京大学基础研究深厚和学科交叉融合的优势，加强产学研深度融合，积极推动科技成果向现实生产力转化，加速创新链与产业链融合，逐步形成概念验证、科技金融、企业管理、中试熟化等服务能力，为科技成果转化工作提供专业化服务。坚持以管资本为主加强所属企业国有资产监管，建立健全产权清晰、权责明确、事企分开、管理科学的现代企业制度，聚焦科技创新，促进企业高质量发展，更好地服务于高校“双一流”建设和立德树人根本任务的落实。